彭绍亮

教授

基本情况

彭绍亮,国家重大人才工程第一层次,2024年全球前2%顶尖科学家(人工智能),2023年湖南省首届“湘江榜样”(10位),2023年度湖南省数字化十大杰出人物。主持湖南省“创新群体“和”“杰出青年”基金,湖南大学二级教授/博导,国家超级计算长沙中心副主任。从事高性能计算、大数据、生物信息、人工智能、区块链等研究,国防科技大学兼职教授。出版专著8部,发表学术论文两百余篇,论文引用9500余次,授权发明专利50余项。获2019年国家科技进步二等奖,2019年湖南省技术发明一等奖(排名1),2013年军队科技进步一等奖1项,2021年CCF技术发明二等奖(排名1),2018年CCF自然科学二等奖(排名1),2016年荣立三等功。是中央军委、国家科技部/工信部/教育部会评专家、中国计算机学会理事、CCF计算机应用和生物信息专委副主任和YOCSEF总部AC委员、CCF高性能计算、大数据专委常委、区块链专委委员,湖南省生物信息学会和湖南省生物医学工程学会理事长,担任2个SCI期刊执行主编,创立全球首个《Metaverse》元宇宙国际期刊,任Editor-in-Chief(主编)。

E-mail:slpeng@hnu.edu.cnpengshaoliang@gmail.com

教育及工作经历

2024年:

2024年全球前2%顶尖科学家(人工智能)

2024年11月21,2024年首届紫荆中医药国际峰会,多模态生物医药大数据和人工智能大模型分论坛演讲报告

2024年10月-至今,中国工商银行股份有限公司湖南省分行 科技金融战略专家

2024年11月2日,2024年湖南省生物医学工程大会暨医工融合创新学术交流大会,主题报告

2024年10月26日,2024年世界生物医药与人工智能大会,大会主席和大会主题报告人

2024年10月至今,中国生物医学工程学会-科技经济融合工作第十一届委员会 委员

2024年出版科普专著《AIGC+元宇宙/Web3.0 100问:洞悉数字经济时代的底层技术》入选CCF第五期“科普阅读推荐图书”(10部)

2024年9月-至今,中国传媒大学数据科学与智能媒体学院智能学科发展战略咨询委员会特聘顾问

2024年9月-至今,雄安国创中心科技有限公司大数据与人工智能特聘专家

2024年10月12日,中华预防医学会生物信息学会回第二届学术会议,苏州,多模态生物医药大数据和人工智能大模型学术讲座

2024年9月,湖南省医学会放射学专业委员会第二十六届学术年会暨医学会影响技术专业委员会第十一届学术年会,长沙,人工智能医学影新技术:大模型训练大模型,魔法打败魔法学术讲座

2024年7月,中国指挥与控制学会首届全国大模型与决策职能大会(CCLD 2024),杭州,元宇宙Web3.0时代下的生成式人工智能大模型主题演讲

2024年6月26日,中国计算机学会CCF学生领航计划,演讲嘉宾

2024年5月24日,中国生物信息学学会(筹)技术生物学与生物信息算法研究专委学术大会暨第二届山东省生物信息学学术大会,青岛,神农GPT:多模态药物大模型 特邀报告

2024年3月至今,CCF大模型论坛常委-执行委员

2024 15th IEEE International Conference on Software Engineering and Service Science,Conference Chairs

2023年:

2023年12月21日,2023中国大数据技术大会,北京,大会报告

2023年12月24日,大数据专委2023中国大数据技术大会BDTC,广州,Web 3.0时代下的健康数字孪生和电子药主题演讲

2023年12月23日,2023年信息技术类学院院长联席会暨八桂科技讲坛,桂林,Web3.0时代下的算力网络和人工智能应用与推断关键技术研究主题演讲

2023年12月22日,大数据专委2023中国大数据技术大会BDTC,广州,算力网络和人工智能应用主题演讲

2023年12月16日,“理工融合 创新发展”高端学术论坛,长沙,Web3.0时代下的人工智能教育大模型主题演讲

December 15, 2023,18th International Conference on Bioinspired Computing: Theory and Applications,Changsha,ShennongGPT: A Fine-tuning LLM Model for Medication Guidance

2023年11月19日,2023第六届中国教育创新成果公益博览会,珠海,算力网络和教育元宇宙主题演讲

2023年10月27日,CNCC论坛报告,沈阳,药物发现人工智能大模型主题演讲

2023年3月,聘请为国防科技大学军队高层次科技创新人才工程青年科技英才带教导师

2023年9月24日,华中科技大学计算机科学与技术专业学术报告会,武汉,大会报告

2023年8月21日,2023年首届中国林草高新技术应用大会,张家口,基于人工智能算力的林草新技术应用主题演讲

2023年8月20日,2023年第二届国防基础理科“基石”青年学者论坛,长沙,大会报告

2023年7月21日-23日,2023年光合基金开发者大会,昆山,大会报告

2023年7月22日,2023年第三届湖南省数字产业高峰论坛,长沙,Web3.0时代下的算力网络和应用主题演讲

2023年7月15日,2023年第六届CCF中国区块链技术大会暨区块链专业委员会成立五周年庆典,南京,Web3.0时代下的算力网络和应用主题演讲

2023年6月30日,2023年重庆市第四届互联网医院建设暨健康医疗大数据应用交流大会,重庆,Web3.0时代下的健康数字孪生和电子药主题演讲

2023年6月17日,2023年第二届湾区“互联网医疗”高峰论坛暨健康160第6届医生影响力年度盛典,深圳,Web3.0时代下的健康数字孪生和电子药主题演讲

2023年6月2日,2023年首届粤港澳医药创新发展大会,广州,人工智能与新药研发论坛报告

2023年5月至今,中国元宇宙技术与应用创新平台成立大会副理事长

2023年5月21-23日,南京2023元宇宙应用共创大会-中国元宇宙技术与应用创新平台成立大会,南京,大会报告

2023年5月,中国联通追光行动发布会,长沙,“Web3.0时代下的算力网络”主题演讲

2023年5月12日-15日,第九届全国计算生物学与生物信息学学术会议暨生物医学大数据与人工智能大会,徐州,大会报告

2023年5月11日,CCF计算机应用专委走进华南师范大学CCF@U第948场,华南师范大学软件学院,大会报告

2023年5月9日-12日,第五届中国生命电子学术年会,佛山,大会特邀报告

2023年03月,中国电子学会第17期“CIE电子信息云讲堂”优秀讲者

2023年03月,中国计算机学会中国数字经济产业发展大会(CCDE)专题论坛讲者

2023年03月,湖南省长沙天心区经济开发区管理委员会园区顾问

2023年02月,中国计算机学会2022年度CCF杰出演讲者—DSP三星讲者

2023年02月,机械工业出版社专家委员会成员

2023年01月,湖南省科学技术馆首席专家顾问

2022年:

制定专病数据库建库和应用标准-《专科疾病标准数据集建设规范》标准链接;

2022年11月,湖南省元宇宙产业创新联盟联合发起人、联席理事长

2022年11月,全国高校人工智能与大数据创新联盟元宇宙专业委员会副主任委员

2022年10月至今,中国计算机学会开源发展委员执行委员

2022年10月至今,中国计算机学会计算艺术分会执行委员

2022年10月至今,中国计算机学会科学普及工作委员会执行委员

2022年10月至今,中国计算机学会标准工作委员会执行委员

2022年10月12日至今,全国高校人工智能与大数据创新联盟元宇宙专委会副主任

2022年9月23日-25日,第十八届全国高性能计算学术年会(简称CCF HPCChina2022),济南,大会特邀报告

2022年8月25日-28日,湖南省医师协会放射医师年会,长沙,大会特邀报告

2022年8月21日-23日,International Conference on Internet of Things, Communication and Intelligent Technology,Keynote Speaker

2022年7月,中国计算机应用大会(CCF NCCA 2022)大会监督委员会主席

2022年07月25日,第八届全国计算生物学与生物信息学学术会议(NCCBB),广州,大会特邀报告

2022年7月23日,2022未来计算机教育峰会(FCES 2022 ),苏州,论坛报告

2022年7月2日,湖南省医学会放射学专业委员会第二十四届年会,长沙,大会特邀报告

2022: InternationalConference on Internet of Things, Communication and Intelligent Technology (GeneralChairs大会主席), http://www.iotcit.org/committee/

2022: 4thInternational Conference on Blockchain Technology(第四届区块链技术国际会议) (Confernece Co-Chairs大会联合主席), http://www.icbct.org/com.html

2021年:

2021.12.28: The 11th International Conference on Image and Graphics (ICIG),

Symposium: Big Data Analysis and Modeling for the Brain Atlas, invited talk

2021.12.27: CCF中国区块链技术大会(CCF CBCC2021),大会特邀报告

2021.12.26: CCF第十一届太湖论坛——自主可控高性能与智能计算大会,大会特邀报告

2021.12.09:2021年智慧康养职业技术教育国际学术研讨会,主题报告

2021.11.26:ISBRA 2021 : International Symposium on Bioinformatics Research and Applications, Keynote Talk(第17届生物信息学研究与应用国际研讨会,大会报告)

2021.10.26:第十届全国生物信息学与系统生物学学术大会/大会报告

2021:“如何利用人工智能实现医疗影像多病种识别并进行辅助诊疗?”入选2021中国科协十大工程技术难题

2021:第四届区块链技术国际会议(The 2022 4th International Conference on Blockchain Technology, ICBCT 2022)大会联合主席

2021.7.31:第七届中国中医药信息大会主旨演讲

2021.7.16:第七届全国计算生物学与生物信息学学术会议程序委员会主席/大会特邀报告

2021.6.15:健康医疗大数据中国50人

2021.5-中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会副主任

2021:中国通信工业协会区块链专业委员会终身副主任委员;

2021:吴文俊人工智能科学技术奖十周年颁奖盛典暨2020中国人工智能产业年会杰出贡献者

2020年:

制定国内人工智能诊疗标准-《智能医疗影像辅助诊断系统技术要求和测试评价方法》标准链接;

IEEE EDGE 2020: IEEE International Conference on Edge Computing (CCF C区国际会议) Program Committee

ICPADS 2020: International Conference on Parallel and Distributed Systems (CCF C区国际会议) TPC Committee of the System Track

2020:湖南省人工智能协会专家委员会副主任

2020.6.12-14:第七届全国计算生物学与生物信息学暨国际人工智能与生物医学信息学学术会议大会程序委员

2019年:

2020-2022:中国计算机学会(CCF)第十二届理事会理事

2019.12.27-28:济南国际超级计算产业博览会“超算产业分论坛”特邀嘉宾(报告题目:医疗大数据驱动下的智慧医疗-AI辅助诊疗、边缘计算、区块链等)

2019.10.17:CNCC-“大数据时代下的智能计算”论坛讲者

2019.10.17:CNCC-“生命在于计算——CCF生物信息专委分论坛”主席

2019.10.19-20:第一届全国生物信息与传染病交叉论坛特邀讲者

2019.9.11-13:OFweek2019中国智慧医疗产业大会医疗人工智能专场主持人和报告人

2019.9.9-11:2019世界计算机大会“新型计算:再造数字经济活力”特邀讲者

2019: 2019世界计算机大会"新型计算:再造数字经济活力"论坛特邀讲者

2019: 2019 CCF青年精英大会(YEF 2019)“深度学习技术如何推动产业升级”论坛特邀讲者

2019.3-2022.3:上海健康医学院双加应急医学救援技术研究院人工智能与超算专家

APBC 2019: The 17th Asia Pacific Bioinformatics Conference (CCF C区国际会议) PC Committee Chairs

2018年:

2018.12-2022.12:湖南省神经科学学会第二届委员会常务理事

2018-至今:鹏城实验室智慧医疗子课题负责人

2018:新一代人工智能院士高峰论坛智慧医疗论坛特邀嘉宾

2018-至今:中国老年医学学会智慧医疗技术与管理分会会长

2018:CNCC-“E级超算——E级计算时代下的HPC与AI融合之路”论坛主席

2018:中国计算机学会(CCF)Young Elite Forum“科技创业秀”特邀评委

2018:CNCC-“面向E级超级计算机的应用算法与软件”论坛讲者

2018:HPC China 2018第十四届全国高性能计算学术年会大会特邀演讲者

2018:新华小记者湖南顾问委员会科普教育高级导师

2017年:

2017-至今:湖南省生物信息学会(一级学会)理事长

2017:第2届中国计算机学会生物信息学会议程序委员会主席

2017-至今:CCF YOCSEF总部AC委员

2017:2017中国大数据技术大会组委会主席

2017:CCF CNCC 2017“HPC+AI”论坛主席

2017:CCF CNCC 2017“第四届智能健康医疗健康论坛”论坛主席

2017-至今:广西科技大学启迪数字学院学术委员会委员

2017-至今:华大基因学院认证讲席教授

2016年:

2016-至今:中央军委科技委生物交叉立项专家组成员

2016-2019:中国计算机学会(CCF)第十一届理事会理事

2016-至今:中国计算机学会(CCF)生物信息专业组副主任

2016:CCF中国大数据技术大会(BDTC 2016)程序委员会主席

2016:CCF中国大数据学术大会程序委员会副主席

2016.12-2017.12:CCF YOCSEF长沙主席

2016-至今:中国大数据技术应用联盟委员会专家

2016-至今:中国计算机应用大会委员会委员

2016-至今:中国大数据产业应用协同创新联盟委员会专家

2016:中国计算机学会(CCF)YOCSEF广州2016互联网大数据协同创新论坛

2016:CNCC-高性能计算与大数据论坛主席

2016:CNCC-生命在于计算论坛主席

2016:CNCC-医疗大数据论坛讲者

2016:IEEE-BIBM 2016-invited speaker

2015年:

2015-至今:中国计算机学会(CCF)计算机应用专委副主任

2015-至今:中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会第二届委员会委员

2015-至今:上海数据科学重点实验室数据科学家

2015-至今:华大基因特聘教授

2015-至今:上海数据科学家大会执行委员会委员

科研项目

[1]湖南省2023年度十大技术攻关项目“算力网络构建关键技术”,2023/01至2025/12,200万(1000万),

[2]在研,参与

[3]人工智能AI4S专项,新型XXXX药物定位研究,2023/6-2025/6,150万,在研,参与

[4]科技部重点研发计划(2022YFC3400400)国家重点研发计划“前沿生物技术”重点专项“高精度全景转录组深度解析技术”,2022/4-2027/4,80万,在研,参与

[5]科技部重点研发计划(2023YFC3503404)中医药应对重大新发疫病的防治一体化关键技术研究-课题4多模态数据融合的全过程疫病应急防控超算平台关键技术研究,2023/11-2027/10,120万,在研,参与

[6]科技部重点研发计划(2018YFC0910405)精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发-课题5高通量生物医学数据高效算法与并行计算,2018/06-2020/12,258万,已结题,课题5负责人

[7]国家重点研发计划(2017YFB0202602)基于E级高性能计算生物医药应用软件系统及应用-联合中山大学

[8]国家重点研发计划(2017YFC1311003)恶性肿瘤临床大数据平台及生物样本库建设研究-基于超级计算的肿瘤大数据分析技术与人工智能诊断标准研究—联合中国医学科学院肿瘤医院&中国肿瘤中心

[9]国家重点研发计划(2016YFC1302500)中国主要恶性肿瘤的危险因素监测及控制关键技术研究—联合中国医学科学院肿瘤医院

[10]国家重点研发计划(2016YFB0200400)E级计算机关键技术验证系统

[11]国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目,62361166662,高通量药物发现大模型关键技术研究,2024/01-2026/12,170万,在研,项目负责人

[12]国家自然科学基金联合重点项目,U19A2067,面向复杂环境的边缘计算支撑关键技术,2020/01-2023/12,300万,已结题,项目负责人

[13]国家自然科学基金联合重点项目,U1435222,面向生物威胁快速反应的大数据分析方法研究,2015/01-2018/12,480万,已结题,参与(子课题负责人)

[14]国家自然科学基金面上项目,61772543,面向大规模异构体系结构的生物医药大数据并行算法及优化关键技术研究,2018/01-2021/12,80万,已结题,主持

[15]国家自然科学基金面上项目,61272056,面向城市计算的协作认知无线电网络资源优化理论与关键技术研究,2013/01-2016/12,80万,已结题,主持

[16]国家自然科学基金青年项目,60903223,传感器网络辅助下的认知无线电动态频谱资源管理研究,2010/01-2012/12,18万,已结题,主持

[17]基于5G的人工智能中医诊疗平台,2021-08至2024-08

[18]基于5G的远程重症智慧监护和精准外科,2021-08至2024-08

[19]湖南省自科基金创新群体项目,2024JJ1002,湖南省自然基金创新群体项目“基于超算的大数据与人工智能关键技术及应用”,2024-2026,100万,在研,主持

[20]湖南省重点研发计划项目,2023SK2059,湖南省重点研发计划项目“心血管疾病危险因素防治医工结合精准诊疗技术及转化研究”,2023/7-2027/10,80万,在研,参与

[21]军委科技委,抽象概率正则化XXXXX的应用,2023/12-2025/12,66万,在研,参与军委科技委,带宽XXXXX调度技术研究,2023/12-2025/12,130万,在研,主持

[22]国防科技项目管理中心,面向xxxxxxx智能关联,2023/1-2024/12,100万,在研,参与

[23]广东省重点研发,2023B1111030004,2022年度广东省重点领域研发计划“精准医学与干细胞”重点专项——慢性肾脏病的精准预测、诊断和干预研究,2023/1-2025/12,1600万,在研,参与

[24]湖南省十大技术攻关项目,2023GK1010,算力网络构建关键技术,2023/1-2025/12,160万,在研,参与

[25]湖南省重点研发计划项目,2023GK2004,基于超算的生物医药大数据并行计算技术及应用,2023/7-2025/7,80万,在研,主持

[26]湖南省重点研发计划项目,2023SK2060,湖南省重点研发计划项目“基于人工智能和混合现实技术的肝胆外科精准手术规划系统研发,2023/7-2025/7,80万,在研,参与

[27]华为技术有限公司,YBN2020065023,XX语言兼容性实现,2020-06至2021-06,713万,已结题,主持

[28]湖南省杰出青年基金,2020JJ2009,基于超算的医疗大数据技术研究,2020/01-2022/12,50万,已结题,主持

[29]科技创新特区前沿科技创新项目,19***01,面向***的大数据智能挖掘技术研究,2019/06-2020/12,100万,已结题,项目负责人

[30]横向课题,同步并行优化新药快速发现的超算研发服务,2019/06-2020/12,75万,在研,项目负责人

[31]湖南省自科发展基金 10631 无线传感器网络辅助下的动态数据驱动并行仿真技术研究

[32]广州超算应用研发项目 1488064512003 基于大规模异构高性能计算系统的生物信息分析软件

[33]国防科技大学预研项目 JC12-06-03 面向复杂系统的大规模动态数据驱动并行算法研究

[34]国家自然科学基金委员会-广东省人民政府大数据科学研究中心项目:基于天河二号超级计算机的智慧医学与健康

[35]大数据平台研究与构建2016年度广东省科技发展专项资金(协同创新与平台环境建设方向“基因大数据分析及产业化研究”-中国科学院深圳先进技术研究院+华大基因)

[36]深圳发改委项目“高技术服务业研发及产业化专项(专题二:信息技术服务):面向PB级生物基因数据处理的国民健康服务平台”

[37]“天河1号”-国家863计划重大项目“千万亿次高效能计算机系统”项目

[38]“天河2号”-国家863计划重大项目“天河新一代高性能计算机系统研制”项目

[39]广东省科技厅项目基金 2016B090918122

[40]广州天河飞腾项目 0702060112002

[41]银河工程项目基金 0302060112001

学术成果

科研著作

[1] 2024年出版科普专著《AIGC+元宇宙/Web3.0 100问:洞悉数字经济时代的底层技术》入选CCF第五期“科普阅读推荐图书”(10部)

[2] 2023年出版 《AIGC+元宇宙/Web3.0 100问:洞悉数字经济时代的底层技术》,机械工业出版社;

[3] 2021 Blockchain for Big Data: AI, IoT and Cloud Perspectives, CRC Press;

[4] 2021年出版 《生物医药大数据与智能分析》,中国邮电出版社;

[5] 2021年出版 《医学预测学》,科学出版社;

[6] 2019年出版 《云计算与大数据技术理论及应用》,清华大学出版社;

[7] 2018年出版 《大数据导论》,高等教育出版社;

[8] 2013年出版 《大规模社会网络中影响最大化高效处理技术》,国防工业出版社;

[9] 2010年出版 《无线传感器网络中高效传输技术》,国防科技大学出版社。

发表论文:

[1] Yutao Dou, Wei Li, Yangtao Zheng, Xiaojun Yao, Huanxiang Liu, Albert Y.Zomaya and ShaoliangPeng*, Quick-MIMIC: A Multimodal DataExtraction Pipeline for MIMIC with Parallelization, Big Data Mining andAnalytics(中科院一区,IF 13.6)

[2] Wenwu Zeng, Yutao Dou, Liangrui Pan, Liwen Xu*, Shaoliang Peng*. Improving prediction performance of general protein language model by domain-adaptive pretraining on DNA-binding protein. Nature Communications, 2024. (中科院一区,top期刊)

[3] Boya Ji, Xiaoqi Wang, Debin Qiao, Liwen Xu*, Shaoliang Peng*. SpaCCC: Large language model-based cell-cell communication inference for spatially resolved transcriptomic data[J]. Big Data Mining and Analysis, 2024: 2024.02. 21.581369.中科院一区

[4] Xiaoqi Wang, Yuqi Wen, Yixin Zhang, Chong Dai, Yaning Yang, Xiaochen Bo, Song He, Shaoliang Peng*. A hierarchical attention network integrating multi-scale relationship for drugresponse prediction. Information Fusion,2024.(CCF A类期刊,IF18.6,通讯作者)

[5] Xiongjun Zhao, ZhengYu Liu, Fen Liu, Guanting Li, Yutao Dou, Shaoliang Peng*. Report-Concept Textual-Prompt Learning for Enhancing X-ray Diagnosis. ACM MM,2024.(CCF A类会议,通讯作者)

[6] Pronthep Pipitsunthonsan, Liangrui Pan, Shaoliang Peng, Thanate Khaorapapong, Sutkhet Nakasathien, Sittiporn Channumsin, Mitchai Chongcheawchamnan. Palm bunch grading technique using a multi-input and multi-label convolutional neural network. Computers and Electronics in Agriculture, 2023. (中科院一区,top期刊)

[7] Hong Wang, Chong Dai, Yuqi Wen, Xiaoqi Wang, Wenjuan Liu, Song He, Xiaochen Bo, Shaoliang Peng*. GADRP: graph convolutional networks and autoencoders for cancer drug response prediction. Briefings in Bioinformatics, 2023. (中科院一区,top期刊,通讯作者)

[8] Shaoliang Peng*, Wenxuan Bao, Hao Liu, Xia Xiao, Jiandong Shang, Lin Han, Shan Wang, Xiaolan Xie, Yang Xu. A Peer-to-Peer File Storage and Sharing System Based on Consortium Blockchain. Future Generation Computer Systems, 2023. (SCI 1区, top期刊, 第一作者、通讯作者)原文链接

[9] Xiaoqi Wang, Yingjie Cheng, Yaning Yang, Fei Li, Shaoliang Peng*. Multi-task Joint Strategies of Self-supervised Representation Learning on Biomedical Networks for Drug Discovery. Nature Machine Intelligence, 2023. 原文链接

[10] Xiaoxiao Cheng, Chong Dai, Yuqi Wen, Xiaoqi Wang, Song He, Xiaochen Bo, Shaoliang Peng*. NeRD: a multichannel neural network to predict cellular response of drugs by integrating multidimensional data. BMC Medicine, 2022. 原文链接

[11] Yaning Yang, Xiaoqi Wang, Deshan Zhou, Dong-Qing Wei, Shaoliang Peng*, SVPath: an accurate pipeline for predicting the pathogenicity of human exon structural variants, Briefings in Bioinformatics, 2022.

[12] Xiaoqi Wang, Yaning Yang, Kenli Li, Wentao Li, Fei Li, and Shaoliang Peng*. BioERP: biomedical heterogeneous network based self-supervised representation learning approach for entity relationship predictions. Bioinformatics, 2021.

[13] Deshan Zhou, Zhijian Xu, WenTao li, Xiaolan Xie & Shaoliang Peng*. MultiDTI: Drug-target interaction prediction based on multi-modal representation learning to bridge the gap between new chemical entities and known heterogeneous network. Bioinformatics, DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab473, 2021.原文链接.

[14] Xiaoqi Wang, Bin Xin, Weihong Tan, Zhijian Xu, Kenli Li, Fei Li, Wu Zhong & Shaoliang Peng*. DeepR2cov: deep representation learning on heterogeneous drug networks to discover anti-inflammatory agents for COVID-19. Briefings in Bioinformatics, 2021.DOI:10.1093/bib/bbab226 (SCI 1区, IF=11.62,通讯作者)原文链接.

[15] J Li, Y Li, W Li, H Luo, Y Xi, S Dong, M Gao, ... S Peng*, F Wu and W Yu. Guide Positioning Sequencingidentifies aberrant DNA methylation patterns that alter cell identity andtumor-immune surveillance networks. Genome Research. 2019, 29:270-280. (SCI一区, top期刊,IF=10.10,并列通讯作者)

[16] Zhang, Z.,Zhao, Y., Liao, X., Shi, W., Li, K., Zou, Q*., Peng, S.* Deep Learning in omics: a survey and guideline. Briefings in Functional Genomics, 2019,18(1):41–57.(ESI高被引论文,并列通讯作者)

[17] Shaoliang Peng* , Yingbo Cui , Shunyun Yang , Wenhe Su , Tenglilang Zhang , et al. A CPU/MIC Collaborated Parallel Framework for GROMACS on Tianhe-2 Supercomputer. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2019,16(2):425 - 433.(JCR一区,CCF B类,第一作者、通讯作者)

[18] Gaole An, Jiaqi Sun, Chao Ren, Zhangyi Ouyang, Lingyun Zhu, Xiaochen Bo, Shaoliang Peng*, Wenjie Shu. LIVE: a manually curated encyclopedia of experimentally validated interactions of lncRNAs. Database. 2019:1-6.(JCR一区,通讯作者)

[19] Bu, D., Peng, S.*, Luo, H., Li, X., Li, H., Sun, L., ... & Yi, Z. From big data to knowledge in precision medicine. Science. 2018:359(6375):P35-38.(并列第一作者)

[20] Guo, R., Zhao, Y., Zou Q., Fang X., & Peng, S.* Bioinformatics applications on Apache Spark. GigaScience. 2018,7(8):1-10.(SCI一区,top期刊,通讯作者)

[21] Cui, Y., Peng, S.*,Lu, Y., Zhu, X., Wang, B., Wu, C., & Liao, X. mSNP: A Massively Parallel Algorithm for Large-Scale SNP Detection. IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems. 2018,29(11):2557-2567. (JCR一区,CCF A类,通讯作者)

[22] Peng, S., Lu, Y., Liao, X., Lu, K., Yang, C., ... & Wei, D. High-scalable Collaborated Parallel Framework for Large-scale Molecular Dynamic Simulation on Tianhe-2 Supercomputer. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2018,13:1-1(JCR一区,CCF B类,第一作者、通讯作者)

[23] Dong, D., Su, W., Shi, W.,Zou, Q., & Peng, S.* (2018). VCSRA: A fast and accurate multiple sequence alignment algorithm with a high degree of parallelism. Journal of Genetics and Genomics. 2018,45(7): 407–410.(JCR一区,通讯作者)

[24] Peng, S., Yang, S.,Bo, X., & Li, F. paraGSEA: a scalable approach for large-scale gene expression profiling. Nucleic acids research. 2017,45(17),e155-e155(SCI一区,top期刊,IF=11.15,第一作者)

[25] Liao, X., Zhu,H., Li, K., Shi, B., & Peng, S.* A novel algorithm for detecting co-evolutionary domains in protein and nucleotide sequences. In 2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM) (pp. 56-61). (CCF B类会议,第一作者、并列通讯作者)

[26] Xiao, M., Li, J., Li, W.,Wang, Y., Wu, F., Xi, Y., ... & Peng, S. .MicroRNAs activategene transcription epigenetically as an enhancer trigger. RNAbiology. 2017,14(10),1326-1334(JCR一区,通讯作者).

[27] Peng, S. High performance computational biology and drug design on TianHe Supercomputers. In 2016 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM) (pp. 7-7).(CCF B类会议,第一作者、通讯作者).

[28] Peng, S., Lu, Y., Liao, X., Lu, K., Yang, C., ... & Wei, D. mAMBER:A CPU/MIC collaborated parallel framework for AMBER on Tianhe-2 supercomputer. In 2016 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM) (pp. 651-657). (CCF B类会议,第一作者).

[29] Liu, X., Li, M., Li, S., Peng,S*., Liao, X., & Lu, X. IMGPU: GPU-accelerated influence maximization in large-scale social networks. IEEE Transactions on Paralleland Distributed Systems. 2014,25(1):136-145.(JCR一区,CCF A类,并列通讯作者)

[30] Peng, S., Xing, G.,Li, S., Jia, W., & Peng, Y. Fast release/capture sampling inlarge-scale sensor networks. IEEE Transactions on Mobile Computing. 2012,11(8),1274-1286 (JCR一区,CCF A类,第一作者、通讯作者)

[31] Luo, R., Liu, B., Xie, Y.,Li, Z., Huang, W., Yuan, J., ... & Peng, S. SOAPdenovo2: an empirically improved memory-efficient short-read de novo assembler. Gigascience.2012, 1(1), 18.(ESI高被引论文,引用次数超过1943,SCI一区,top期刊)

发明专利:

[1] 2024年授权 专利号ZL202210427451.8 一种基于生成式对抗网络的基因序列插补方法

[2] 2024年授权 专利号ZL202210391128.X基于图神经网络和自动编码器的抗癌药物敏感性预测方法

[3] 2024年授权 专利号ZL202210387736.3一种基于多分辨率重叠注意力机制的医学影像分割方法

[4] 2024年授权 专利号ZL202210274125.8基于改进蛋白质序列位置特异性矩阵的DNA结合蛋白识别方法

[5] 2024年授权 专利号ZL202210038022.1一种变异数据降维输入的驴种群自然选择分类系统

[6] 2024年授权 专利号2024100840934一种基于SGX的区块链联邦学习方法及系统

[7] 2024年授权 专利号2024100373388基于超算平台的医疗数据并行集成处理方法及系统

[8] 2024年授权 专利号202410010463X一种基于多视图学习的miRNA-疾病关联预测方法

[9] 2024年授权 专利号ZL202410010495X一种基于多视图注意力解读细胞间主要通讯组件的方法

[10] 2024年授权 专利号ZL2024100105416一种基于多源异构图学习的蛋白质相互作用预测方法

[11] 2024年授权 专利号ZL2024100768043一种基于图卷积网络的多模态生理信号分析方法

[12] 2024年授权 专利号ZL202210427451.8一种基于生成式对抗网络的基因序列插补方法

[13] 2024年授权 专利号ZL2024100840934一种基于SGX的区块链联邦学习方法及系统

[14] 2023年授权 专利号ZL202111044208.X基于卷积去噪自编码机的piRNA-疾病关联关系预测方法

[15] 2023年授权 专利号ZL202110446165.1基于神经网络的自然选择分类和群体规模变化分析系统

[16] 2023年授权 专利号ZL202110865026.2一种基于自监督图表征学习的药物重定位预测方法

[17] 2023年授权 专利号ZL202210746181.7一种基于隐私保护的药物相似性计算方法

[18] 2023年授权 专利号ZL202210551138.5一种基于联盟区块链的电子病历安全可控共享方法

[19] 2022年授权 专利号ZL202010803336.7一种基于深度学习的多方位X光胸片肺炎诊断方法

[20] 2022年授权 专利号ZL201910296276.1一种基于深度学习的基因表达谱距离度量方法

[21] 2022年授权 专利号ZL202011226195.3一种基于元路径和双向编码器的生物网络链接预测方法

[22] 2022年授权 专利号ZL202110321988.1一种基于多通路图卷积神经网络的药物靶标预测方法

[23] 2022年授权 专利号ZL202110898820.7一种基于VAE数据增强的CRISPR/Cas9脱靶预测方法

[24] 2022年授权 专利号ZL202010531562.4一种基于深度学习多源异构网络的药物重定位方法

[25] 2022年授权 专利号ZL201910506027.0一种基于高通量测序数据的溶源性噬菌体预测方法

[26] 2022年授权 专利号ZL202010288303.3一种基于异构信息的药物-靶标相互作用预测方法

[27] 2022年授权 专利号ZL202010030316.0一种基于深度学习的CRISPR脱靶效应预测方法

[28] 2022年授权 专利号ZL202010803348.X一种基于局部有偏的蛋白质结构预测方法

[29] 2022年授权 专利号ZL202110627869.9一种基于联盟链的分布式文件存储共享系统

[30] 2022年授权 专利号ZL202010725014.5基于图表示学习的新冠病毒靶标预测和药物发现方法

[31] 2022年授权 专利号ZL202110635383.X基于深度学习的彩色图像龋病识别方法

[32] 2021年授权 专利号ZL202110925770.7基于spark计算引擎的高通量虚拟药物筛选方法及系统

[33] 2021年授权 专利号ZL202111044208.X基于卷积去噪自编码机的piRNA-疾病关联关系预测方法

[34] 2021年授权 专利号ZL202011226196.8一种基于网络表征的抗新冠炎症药物发现方法

[35] 2021年授权 专利号ZL202110364101.7一种基于区块链的主节点公平选举方法

[36] 2021年授权 专利号ZL202010029068.8一种基于自编码器的基因表达谱特征学习方法

[37] 2021年授权 专利号ZL202110159089.6一种基于人工智能的龋病诊断系统

[38] 2021年授权 专利号ZL202011532299.7一种基于子空间随机化单细胞集成聚类方法

[39] 2020年授权 专利号ZL202011419796.6一种基于多源数据融合和网络结构扰动的药物靶标预测方法

[40] 2020年授权 专利号ZL202011299895.5一种基于区块链技术的智慧城市路边停车管理系统

[41] 2020年授权 专利号ZL202011226195.3一种基于元路径和双向编码器的生物网络链接预测方法

[42] 2020年授权 专利号ZL202011225115.2一种基于全局特征关系的卷积神经网络压缩方法

[43] 2020年授权 专利号ZL202010725014.5基于图表示学习的新冠病毒靶标预测和药物发现方法

[44] 2020年授权 专利号ZL202010531562.4一种基于深度学习多源异构网络的药物重定位方法

[45] 2020年授权 专利号ZL202010241653.4一种细菌中功能性前噬菌体及其位置与序列的检测方法

[46] 2020年授权 专利号ZL202010029057.X一种基于注意力的卷积神经网络分频特征提取方法

[47] 2019年授权 专利号ZL201910970181.3一种基于区块链的药企监管方法

[48] 2019年授权 专利号ZL201910539449.8一种基于机器学习的基因表达谱聚类方法

[49] 2019年授权 专利号ZL201910506027.0一种基于高通量测序数据的溶源性噬菌体预测方法

[50] 2019年授权 专利号ZL201910407569.2基于RNN神经网络的可迁移病人分类系统

[51] 2019年授权 专利号ZL201910399732.5一种基于卷积神经网络的阴道病理图像分类方法

[52] 2019年授权 专利号ZL201910381347.8一种基于区块链的疫苗生产监管方法

[53] 2019年授权 专利号ZL201910296276.1一种基于深度学习的基因表达谱距离度量方法

[54] 2019年授权 专利号ZL201910296287.X一种基于共享字典学习的基因表达谱分类方法

[55] 2018年授权 专利号ZL201510960149.9基于动态数据划分和冲突消解的高通量药物虚拟筛选方法

[56] 2017年授权 专利号ZL201410745667.4基于众核协处理器的三级流水序列比对方法

[57] 2017年授权 专利号ZL201310343007.9一种基于MapReduce的非精确任务并行处理方法

[58] 2016年授权 专利号ZL201410029703.7一种基于内容分块的远程文件实时更新方法

[59] 2016年授权 专利号ZL201310294071.2一种减少无线通信丢包率的方法和设备

[60] 2015年授权 专利号ZL201210248732.3一种基于图形处理单元的影响最大化并行加速方法

[61] 2014年授权 专利号ZL201210370492.4一种基于超级计算机的HLA仿真程序的对象调度方法

[62] 2014年授权 专利号ZL201110459479.1移动传感器网中利用管道的节点部署方法

[63] 2014年授权 专利号ZL201218001015.1一种虚拟试验运行控制方法

[64] 2012年授权 专利号ZL201110008407.5一种支持差异度量的角色动态转化方法

[65] 2012年授权 专利号ZL201010510055.9基于社区特性的并行离散事件仿真对象分发方法

奖励与荣誉

[1] 2024广西科学技术奖—广西省科技进步二等奖—基于信任的“端-边-云”协同计算与服务调度关键技术与应用

[2] 2024华为杯·第⑥届中国研究生人工智能创新大赛(2024)—AI用药助手-大模型驱动的智能用药指导系统中 荣获二等奖,指导老师彭绍亮。

[3] 2024彭绍亮入选全职业生涯“全球前2%顶尖科学家榜单”

[4] 2023中国国际大学生创新大赛(2023)——“一针见血”智能采验与云服务领航者中荣获铜奖,指导老师 彭绍亮。

[5] 20232023年12月28日,经中国生物医学工程学会第十一次会员代表大会表决通过,彭绍亮同志当选中国生物医学工程学会第十一届理事会理事

[6] 2023 2023年12月8日彭绍亮荣获“湖南省信息技术标准化技术委员会专家”称号

[7] 2023 2023年10月29日召开的中国计算机学会第十三届会员代表大会上,彭绍亮被选举为中国计算机学会

[8]第十三届理事会理事

[9] 2023 湖南省数字化十大杰出人物

[10] 2023 湖南省“湘江榜样”封面人物(全省10名)

[11] 2023 第六届中国天鸽奖—2023年度感动人物

[12] 2023第八届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛总决赛获“青年红色筑梦之旅”银奖,指导老师 彭绍亮。参赛题目-警外声:留学生跨境反诈骗公益联盟(王小奇)

[13] 2023 中国计算机学会2022年度CCF杰出演讲者—DSP三星讲者

[14] 2023 中国计算机学会优秀服务奖

[15] 2022 2022年09月 获得2022年中国医学人工智能大会(CMAI 2022)演讲荣誉证书

[16] 2022 第24届高交会2022世界元宇宙生态大会/第六届全球5G+VR大会 第五届天鸽奖—元宇宙领军人物奖

[17] 2022 荣获“元宇宙30人”中国元宇宙创新人物奖

[18] 2022 荣获“区块链60人”中国区块链创新人物奖

[19] 2022 第十三届湖南省高等教育教学成果二等奖:双核四翼 专创融合 三全育人 数智化创新创业人才培育与实践

[20] 2021华为区块链高校大赛—最佳代码奖、最佳创意奖,指导老师彭绍亮。参赛题目:电子政务文档点对点共享方案(刘浩)

[21] 2021年度CCF科学技术奖-技术发明二等奖(排名第一)-多源异构大数据智能挖掘与性能优化

[22] 2021年度全国高校人工智能大数据区块链教材建设奖“大数据类”一等奖,《云计算与大数据技术理论及应用》

[23]林伟伟,彭绍亮;清华大学出版社;内容:云计算与雾计算、大数据和生物信息;

[24] 2021年度CCF杰出演讲者

[25] 2019年度国家科学技术奖-国家科技进步二等奖-高效能异构并行调度关键技术及应用

[26] 2019年度湖南省科学技术奖-湖南省技术发明一等奖(排名第一)-基于超算的大数据关键技术及应用

[27] 2019 AIIA杯人工智能巡回赛“Sophon”赛站全国总决赛-二等奖(湖南省赛一等奖)

[28] “建行杯”第五届湖南省“互联网+”大学生创新创业大赛-二等奖-基于超算的人工智能家庭医生

[29] “长沙银行杯”2019年湖南省创新创业大赛-优秀奖-基于超算的人工智能家庭医生

[30]湖南大学教学成果奖一等奖-面向国家战略的高性能计算创新人才培养体系构建与实践

[31] 2018年度湖南大学创新创业优秀指导教师

[32] 2018年度CCF科学技术奖-自然科学二等奖(排名第一) -基于超算的精准医学技术研究

[33] PAC2018(全国并行应用挑战赛)-最佳应用银奖-基于CPU/MIC异构并行的大规模可扩展频繁子图挖掘药物发现工具

[34] 2018年度CCF杰出演讲者

[35] 2017-2018学年度湖南大学创新创业优秀指导教师

[36] 2018年“创青春”全国大学生创业大赛-铜奖-天河超算上的骨质疏松人工智能医生

[37] 2018年“创青春”湖南省大学生创业大赛-金奖-天河超算上的骨质疏松人工智能医生

[38]第四届湖南省“互联网+”大学生创新创业大赛-一等奖-天河超算上的骨质疏松智能筛查机器人

[39] 2017年度中国计算机学会(CCF)杰出会员

[40] PAC2017(全国并行应用挑战赛)-银奖-基于CPU/MIC异构并行的大规模可扩展Motif发现算法优化

[41] PAC2017(全国并行应用挑战赛)-铜奖-蛋白质翻译后修饰位点预测算法GPS的并行化及应用

[42] 2017“天河之星”优秀应用入围奖

[43] 2017, mD3DOCKxb:An Ultra-Scalable CPU-MIC Coordinated Virtual Screening Framework,获得IEEE可扩展计算挑战赛”-Finalist

[44] Awards;

[45] 2016年:军队三等功-XX高性能计算机系统研制

[46] 2016年度CCF杰出演讲者

[47] IGEM2016(国际遗传工程机器设计大赛)-金奖-Development of A NovelBlood-MicroRNA Handy Detection System

[48] with CRISPR

[49] 2015年:PAC2015(全国并行应用挑战赛)-并行基金优秀探索奖

[50] PAC2015(全国并行应用挑战赛)-最佳应用金奖-mD3DOCKxb天河2号上一种高通量药物虚拟筛选平台

[51] IGEM2015(国际遗传工程机器设计大赛)-单项奖-Engineering of a multi-enzymatic reaction accelerator in vivo

[52] IGEM2015(国际遗传工程机器设计大赛)-金奖-Engineering of a multi-enzymatic reaction accelerator in vivo

[53] ISC2015(国际超算大会)-Best Paper Candidate-Large-Scale Neo-Heterogeneous Programming and

[54] Optimizati-on of SNP Detection on Tianhe-2

[55] 2015, The Challenge of Scaling Genome Big Data Analysis Software on TH-2 Supercomputer,获得IEEE可扩展计算挑战赛”-Finalist Awards;

[56] 2014年:PAC2014(全国并行应用挑战赛)-最佳应用金奖-人类全基因组重测序软件流水线深度并行优化

[57] 2013年:军队科技进步一等奖-Z2013YH102-8-XXX并行程序设计环境

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